利用python进行T检验

发布时间：2019-08-10 08:26:17编辑：auto阅读（2301）

引入所需的包

from scipy import stats
import numpy as np

注：ttest_1samp, ttest_ind, ttest_rel均进行双侧检验
$H_0: μ=μ_0$
$H_1: μ≠μ_0$

单样本T检验-ttest_1samp

ttest_1samp官方文档

生成50行x2列的数据

np.random.seed(7654567)  # 保证每次运行都会得到相同结果
# 均值为5，方差为10
rvs = stats.norm.rvs(loc=5, scale=10, size=(50,2))

检验两列数的均值与1和2的差异是否显著

stats.ttest_1samp(rvs, [1, 2])

返回结果：

Ttest_1sampResult(statistic=array([ 2.0801775 , 2.44893711]), pvalue=array([ 0.04276084, 0.01795186]))

分别显示两列数的t统计量和p值。由p值分别为0.042和0.018，当p值小于0.05时，认为差异显著，即第一列数的均值不等于1，第二列数的均值不等于2。

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不拒绝原假设——均值等于5

stats.ttest_1samp(rvs, 5.0)

Ttest_1sampResult(statistic=array([-0.68014479, -0.04323899]), pvalue=array([ 0.49961383, 0.96568674]))

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拒绝原假设——均值不等于5

stats.ttest_1samp(rvs, 0.0)

Ttest_1sampResult(statistic=array([ 2.77025808, 4.11038784]), pvalue=array([ 0.00789095, 0.00014999]))

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第一列数均值等于5，第二列数均值不等于0

stats.ttest_1samp(rvs,[5.0,0.0])

Ttest_1sampResult(statistic=array([-0.68014479, 4.11038784]), pvalue=array([ 4.99613833e-01, 1.49986458e-04]))

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第一行数均值等于5，第二行数均值不等于0

#axis=0按列运算，axis=1按行运算
stats.ttest_1samp(rvs.T,[5.0,0.0],axis=1) 

Ttest_1sampResult(statistic=array([-0.68014479, 4.11038784]), pvalue=array([ 4.99613833e-01, 1.49986458e-04]))

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将两列数据均值分别与5.0和0.0比较，得到4个t统计量和p值

stats.ttest_1samp(rvs,[[5.0],[0.0]])

Ttest_1sampResult(statistic=array([[-0.68014479, -0.04323899],
[ 2.77025808, 4.11038784]]), pvalue=array([[ 4.99613833e-01, 9.65686743e-01],
[ 7.89094663e-03, 1.49986458e-04]]))

两独立样本t检验-ttest_ind

ttest_ind官方文档
生成数据

np.random.seed(12345678)
#loc:平均值  scale：方差
rvs1 = stats.norm.rvs(loc=5,scale=10,size=500)  
rvs2 = stats.norm.rvs(loc=5,scale=10,size=500)

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当两总体方差相等时，即具有“方差齐性”，可以直接检验
不拒绝原假设——两总体均值相等

stats.ttest_ind(rvs1,rvs2)

Ttest_indResult(statistic=0.26833823296238857, pvalue=0.78849443369565098)

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当不确定两总体方差是否相等时，应先利用levene检验，检验两总体是否具有方差齐性。

stats.levene(rvs1, rvs2)

LeveneResult(statistic=1.0117186648494396, pvalue=0.31473525853990908)

p值远大于0.05，认为两总体具有方差齐性。

如果两总体不具有方差齐性，需要将equal_val参数设定为“False”。

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需注意的情况：

如果两总体具有方差齐性，错将equal_var设为False，p值变大

stats.ttest_ind(rvs1,rvs2, equal_var = False)

Ttest_indResult(statistic=0.26833823296238857, pvalue=0.78849452749501059)

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两总体方差不等时，若没有将equal_var参数设定为False，则函数会默认equal_var为True，这样会低估p值

rvs3 = stats.norm.rvs(loc=5, scale=20, size=500)
stats.ttest_ind(rvs1, rvs3, equal_var = False)

正确的p值
Ttest_indResult(statistic=-0.46580283298287956, pvalue=0.64149646246568737)

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stats.ttest_ind(rvs1, rvs3)

被低估的p值
Ttest_indResult(statistic=-0.46580283298287956, pvalue=0.64145827413435608)

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当两样本数量不等时，equal_val的变化会导致t统计量变化
rvs1：来自总体——均值5，方差10，样本数500
rvs2：来自总体——均值5，方差20，样本数100
两总体不具有方差齐性，应设定equal_var=False

rvs4 = stats.norm.rvs(loc=5, scale=20, size=100)
stats.ttest_ind(rvs1, rvs4)

错误的t统计量
Ttest_indResult(statistic=-0.99882539442782847, pvalue=0.31828327091038783)

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stats.ttest_ind(rvs1, rvs4, equal_var = False)

正确的t统计量
Ttest_indResult(statistic=-0.69712570584654354, pvalue=0.48716927725401871)

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不同均值，不同方差，不同样本量的t检验
错误的检验：未将equal_var设定为False

rvs5 = stats.norm.rvs(loc=8, scale=20, size=100)
stats.ttest_ind(rvs1, rvs5)

Ttest_indResult(statistic=-1.4679669854490669, pvalue=0.14263895620529113)

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正确的检验：

stats.ttest_ind(rvs1, rvs5, equal_var = False)

Ttest_indResult(statistic=-0.94365973617133081, pvalue=0.34744170334794089)

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配对样本t检验

ttest_rel官方文档

np.random.seed(12345678)

不拒绝原假设，认为rvs1 与 rvs2 所代表的总体均值相等

rvs1 = stats.norm.rvs(loc=5,scale=10,size=500)
rvs2 = (stats.norm.rvs(loc=5,scale=10,size=500) + stats.norm.rvs(scale=0.2,size=500))
stats.ttest_rel(rvs1,rvs2)

Ttest_relResult(statistic=0.24101764965300979, pvalue=0.80964043445811551)

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拒绝原假设，认为rvs1 与 rvs3所代表的总体均值不相等

rvs3 = (stats.norm.rvs(loc=8,scale=10,size=500) + stats.norm.rvs(scale=0.2,size=500))
stats.ttest_rel(rvs1,rvs3)

Ttest_relResult(statistic=-3.9995108708727924, pvalue=7.3082402191661285e-05)

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